O Departamento de Zootecnia é responsável por importantes disciplinas profissionalizantes as quais são ministradas aos alunos dos cursos de Graduação (Agronomia, Ciências Biológicas, Medicina Veterinária e Zootecnia) e dos cursos de Pós-Graduação oferecidos pela FCAV. Conta atualmente com 26 docentes, em sua maioria qualificados como pesquisadores do CNPq e 30 servidores técnico-administrativos que atuam nas diferentes áreas e/ou culturas da Zootecnia: Animais Silvestres, Apicultura, Avicultura, Bovinocultura de Corte, Bovinocultura de Leite, Bubalinocultura, Caprinocultura, Cunicultura, Equinocultura, Forragicultura e Pastagens, Melhoramento Genético Animal, Nutrição Animal, Ovinocultura, Piscicultura, Ranicultura, Sericicultura e Suinocultura. O Departamento também é responsável por setores zootécnicos e laboratórios que dão suporte às aulas práticas, cursos, pesquisas, atendimento à comunidade e cursos de atualização realizados pelos docentes, além de receber estagiários da FCAV e de outras instituições públicas ou privadas do Brasil e do exterior.